Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35P42766 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35P42766 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms