Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3CBP42338 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms