Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM6P40199 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms