Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP214P35658 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUP214P35658 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP214P35658 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP214P35658 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms