Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms