Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP1P32455 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBP1P32455 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms