Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC02262-201ENST00000416680 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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