Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms