Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E2P29084 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms