Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSSP25774 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms