Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms