Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms