Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HRCP23327 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HRCP23327 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HRCP23327 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HRCP23327 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HRCP23327 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HRCP23327 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HRCP23327 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HRCP23327 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HRCP23327 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms