Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms