Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms