Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms