Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA1P15085 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms