Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT10P13645 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT10P13645 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT10P13645 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT10P13645 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT10P13645 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT10P13645 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT10P13645 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms