Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP1P09874 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP1P09874 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP1P09874 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP1P09874 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms