Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms