Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms