Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRPM2O94759 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPM2O94759 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms