Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3JO75822 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms