Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms