Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH6O60337 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms