Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms