Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC8O43402 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC8O43402 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC8O43402 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMC8O43402 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMC8O43402 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMC8O43402 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms