Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms