Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms