Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms