Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E9PCH4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
E9PCH4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
E9PCH4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
E9PCH4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
E9PCH4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E9PCH4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
E9PCH4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
E9PCH4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E9PCH4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms