Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms