Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms