Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms