Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DXG7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms