Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms