Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms