Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms