Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM223BA6NKX1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM223BA6NKX1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms