Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms