Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms