Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf93-201ENST00000299088 3354 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 THADA-205ENST00000404790 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF8-203ENST00000621519 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HLTF-202ENST00000392912 3896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF8-204ENST00000357988 6024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0087-201ENST00000242109 4283 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MOCS1-203ENST00000373186 4256 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TAGAP-201ENST00000326965 3051 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL6IP4-202ENST00000357866 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP180-201ENST00000363913 330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COX17P1-201ENST00000378775 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP244-201ENST00000390936 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MANBAL-203ENST00000397150 620 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353692.1-201ENST00000405081 755 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL125P-201ENST00000480790 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645924.1-201ENST00000502641 220 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008525.1-201ENST00000508719 676 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008525.2-201ENST00000511000 82 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-2-201ENST00000519345 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD52-217ENST00000544742 463 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009093.3-201ENST00000567688 351 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01387-201ENST00000584361 603 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005498.2-201ENST00000590579 326 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007551.2-201ENST00000613889 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC130343.2-201ENST00000615078 426 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXA11-AS1_2.1-201ENST00000615604 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.88-201ENST00000615890 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092745.3-201ENST00000622868 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00969-286ENST00000627297 708 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHC4-201ENST00000332408 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236 ms