Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL4A6Q14031 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms