Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC060764.1-201ENST00000603811 454 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC117498.3-201ENST00000605409 511 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TUSC8-202ENST00000607312 628 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 POU5F1-208ENST00000620031 573 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP4-7-202ENST00000621138 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAM-201ENST00000287497 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RORC-202ENST00000356728 3050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPCR1-203ENST00000636043 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CRX-202ENST00000539067 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRYD3-201ENST00000301463 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms