Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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