Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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