Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms