Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms