Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms