Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHA12Q9UN75 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms